甘肃有机棉纱与普通棉纱的主要区别在于生产过程、环境友好性、品质和成本等方面：
1. 生产过程
有机棉纱：采用有机农业种植方法，不使用化学合成农药、化肥、转基因种子等，确保棉花生长过程中对环境的影响降到最低。普通棉纱：使用传统农业种植方法，可能会使用化学农药、化肥等，对环境有一定影响。
2. 环境友好性
有机棉纱：对环境友好，减少化学物质对土壤、水源和空气的污染，有利于生态保护。普通棉纱：对环境有一定负面影响。
3. 品质
有机棉纱：由于生长环境更健康，有机棉纤维质地柔软、强度高，不易褪色，手感更佳。普通棉纱：纤维质地可能较差，易褪色，手感可能不如有机棉纱。
4. 成本
有机棉纱：生产成本较高，价格也相对较高。
普通棉纱：生产成本较低，价格也相对较低。
5. 健康与安全
有机棉纱：由于不使用化学物质，对皮肤刺激较小，适合敏感人群。普通棉纱：可能含有化学残留，对皮肤刺激较大，不适合敏感人群。
6. 应用领域
有机棉纱：常用于高端服装、家纺、婴儿用品等领域。普通棉纱：广泛应用于各类服装、家纺、工业等领域。
总之，甘肃有机棉纱与普通棉纱在多个方面存在显著差异，消费者可以根据自己的需求和预算进行选择。